海军总医院呼吸内科，是医院的重点学科，包括全军结节病中心，氩氦刀治疗技术国际培训基地。医疗设备先进，技术力量雄厚。拥有50张病床，年均门诊量20000余人次，年均收治患者1000余人次。设有氩氦刀室、肺功能室、呼吸机室、支气管镜室、睡眠呼吸检测室、呼吸疾病实验室等。是博士、硕士研究生培养点，高级职称6名，博士以上学历6名，其中博士后3名，博士3名。在学科建设方面逐渐形成规模并具有明显的技术特色，尤其在结节病、肺癌、慢性阻塞性肺疾病、重症感染、呼吸衰竭、肺栓塞、鼾症、支气管哮喘等疾病的诊治和研究方面成绩卓著。在科研方面，承担了军内外研究课题10余项，获军队科技进步和医疗成果一等奖1项，二等奖4项，三等奖5项。

        肺结节病诊治是海军总医院呼吸内科的主要特色技术之一，从80年代初开始，在全国率先开展肺结节病诊治的研究，积累了大量病例的临床经验，已诊断和治愈500多例国内外结节病患者。该项技术开展时间最早，治疗病例数最多，居世界领先水平。“肺结节病临床系列研究”获1997年军队医疗成果一等奖。肺泡灌洗液分析、血管紧张素转化酶（ACE）测定、电子支气管镜检查及肺活检，TBLB、TBNA、PET/CT以及镓67同位素扫描等方法对结节病的诊断价值进行了多层次的研究。多次成功地举办了全国结节病诊治学习班，在国内外学术界享有较高的知名度。