立体视觉的研究和应用在国内有较大影响，立体视觉检查图等荣获国际发明奖和国家发明奖，被列为特种行业的检查项目．在国内较早开展白内障超声乳化手术，准分子激光治疗眼屈光不正等新业务达到国内一流水平．曾获军队科技进步、科技成果、医疗成果、二等奖５项。

海军心血管内科中心

海军总医院心血管内科2000年被批准为海军心血管疾病专科中心，科室现有高级专业技术职务6名，硕士以上学位者12名，是硕士研究生联合培养点。科室积极开展国际间合作，与美国加利福尼亚大学医学中心，加拿大蒙特利尔大学医学中心及冷冻导管公司，美国德州医学中心，日本大阪中心医院，哈佛大学医学中心心脏介入中心等学术单位和团体进行了广泛的学术交流。

海军呼吸内科中心

海军总医院呼吸内科2001年被评定为海军专科中心，现有高级专业技术职务4名，硕士以上学位者8名，是博士与硕士研究生联合培养点。科室医疗设备先进，技术力量雄厚，设有结节病专病中心、氩氦刀肿瘤治疗中心、肺功能室、呼吸机室、电子支气管镜室、睡眠呼吸检测室、呼吸疾病实验室等。近年来，承担军内外研究课题10余项，获军队医疗成果一等奖1项，二等奖4项，三等奖5项。

海军骨科中心

承担着对海军航空潜水人员的医疗、保健和健康鉴定任务，开展了飞行员心理、生理变化及飞行前后血浆活动物质的机理研究，取得了有效成果。组织开展的海军航空兵主要飞行科目对人体影响及基础研究获得军队科技进步二等奖。

海军骨科中心

海军总医院骨科2001年被批准为海军骨专科中心，科室现有高级专业技术职务6人，硕士以上学位者10人，是硕士研究生联合培养点。骨科经过40多年的发展和建设，拥有了一批高素质的医护人员队伍和优良的医疗仪器设备，逐步形成了以脊柱外科为中心的专科特色。科室现有生物力学、生化和组织培养三个实验室；设有脊柱、创伤、关节、骨肿瘤和骨病5个专业组，

海军核医学科中心

海军总医院核医学科作为海军核医学专科中心有高级专业技术干部3人，硕士以上学位者2人，年均检查量2500人次。随着符合线路、SPECT检查和核素治疗项目的进一步开展，诊治项目已达43项，工作量逐年增加，取得了良好的社会和经济效益。在国内外学术期刊发表论文60余篇，主编或参编专著10部，获军队科技进步及医疗成果二等奖3项，部级科学技术进步和医疗成果三等奖共6项。